Ông Nguyễn Văn Ngọc, Hiệu trưởng nhà trường giải thích: "Trường THPT Quảng Xương 2 có 1.325 học sinh/3 khối/32 lớp với 70 giáo viên, cán bộ quản lý, giảng dạy. Do năm học 2018 - 2019, tỉ lệ học sinh đậu tốt nghiệp quá thấp, chỉ đạt 89% cho nên trường tổ chức cho các em học sinh lớp 12 học thêm ca 3, ca 4. Còn học sinh lớp 10 và lớp 11 thì học thêm ca 1 và 2, trường chỉ thu 15.000 đồng/buổi. Những năm học trước nhà trường có tổ chức dạy thêm thu 14.000 đồng/buổi, nhưng giáo viên không phải chấm vở về nhà. Năm 2019, phụ huynh yêu cầu chấm vở về nhà nên trường thu thêm 1 nghìn đồng/buổi (thành 15.000 đồng/buổi) để trả công cho giáo viên làm việc thêm, ước tổng thu trong 9 tháng được gần 2,2 tỉ đồng chứ không phải trên 5 tỉ đồng như công dân phản ánh".

Hiệu trưởng Nguyễn Văn Ngọc cho phóng viên xem niêm yết thời khóa biểu và kết luận: “Việc bố trí dạy thêm, học thêm là khoa học, không có tiêu cực…”.

Tuy nhiên, ông Lê Văn Nguồn, Chánh Thanh tra Sở GD&ĐT tỉnh Thanh Hóa cho biết: "Sau khi có thông tin Trường THPT Quảng Xương 2 dạy thêm tràn lan không đúng quy định, đầu tháng 12/2019, Sở GD&ĐT tỉnh đã thành lập đoàn kiểm tra, ngày 31/12/2019, đã có Kết luận số 580 về kiểm tra thực hiện các khoản thu ngoài ngân sách năm học 2019 - 2020 tại trường này".

Kết luận 580 cho thấy, Trường THPT Quảng Xương 2 đã để xảy ra nhiều sai phạm. Đó là tổ chức và thu tiền dạy thêm, học thêm của 32/32 lớp đối với 1.325 học sinh, học theo lớp chính khóa, mỗi lớp trên 30 học sinh, học thêm từ 3 đến 5 buổi/tuần. Từ ngày 26/8 đến 31/10/2019 (hơn 2 tháng), trường này đã thu 1.370.220.500 đồng (trong đó thu chấm vở thêm 1.500 đồng/ca/em).

Về chi dạy thêm: Trường chi theo nội dung tại cuộc họp Ban Giám hiệu, không tổ chức xin ý kiến cán bộ công chức, viên chức. Việc chi không thể hiện trong Quy chế chi tiêu nội bộ…, chỉ riêng tiền học thêm, dạy thêm, Hiệu trưởng được nhận khoảng 29 triệu đồng/tháng.

Về tổ chức vận động tài trợ: Trường tổ chức thu tiền học sinh khối 10 để mua bàn ghế, với mức thu 250.000 đồng/học sinh, tổng thu là 116.500.000 đồng, đã mua 48 bộ bàn ghế, số tiền thừa là 28.180.000 đồng. Nhà trường vận động thu 500.000 đồng/phụ huynh, tại thời điểm kiểm tra 18/32 lớp đã thu được 334.150.000 đồng… Việc, trường thu 250.000 đồng/học sinh và thu phụ huynh đóng góp để bổ sung cơ sở vật chất (sửa chữa thư viện, trang bị lắp đặt vi tính và camera) không có dự toán chi tiết, chưa được Sở GD&ĐT phê duyệt là sai quy định.

Phần kết luận của Sở GD&ĐT tỉnh nêu rõ: Năm học 2019 - 2020 Trường THPT Quảng Xương 2 đã để xảy ra nhiều thiếu sót, tồn tại và kiến nghị xử lý: chấm dứt việc dạy thêm, học thêm, việc thu các khoản trái quy định, tiếp tục quán triệt các văn bản pháp luật liên quan và thực hiện nghiêm túc Công văn số 1890, ngày 29/7/2019 của Sở GD&ĐT về thực hiện các khoản thu, chi ngoài ngân sách; hồ sơ quyết toán thu, chi thực hiện đúng quy định của pháp luật.

Việc phối hợp với cha mẹ học sinh phải thực hiện theo Thông tư số 55/2011 của Bộ GD&ĐT. Nhà trường phải trả lại 116.500.000 đồng cho học sinh khối 10 do thu 250.000 đồng/học sinh trái quy định. Kiểm điểm tập thể, cá nhân và tập trung khắc phục những thiếu sót nêu trên.

Đến ngày 31/12/2019, Sở GD&ĐT Thanh Hóa đã ban hành Quyết định số 564 về việc xử phạt hành chính trong lĩnh vực giáo dục đối với Trường THPT Quảng Xương 2: Phạt 6 triệu đồng theo điểm c, Khoản 1, Điều 7 do tổ chức dạy thêm không đúng quy định; phạt 20 triệu đồng do vận động phụ huynh đóng góp theo Khoản 3, Điều 24 về thu các khoản trái quy định; truy thu 63,7 triệu đồng về ngân sách Nhà nước.